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運輸署公佈新皇崗口岸港方口岸區交通安排，提供專營巴士、專線小巴、的士及短途跨境巴士等多元化公共交通服務。因空間所限交匯處不設公眾停車場，旅客宜善用公共交通工具往返。
新皇崗口岸（港方口岸區）實行 24 小時通關，為配合龐大的跨境人流，運輸署已安排多種公共交通服務接載旅客往返口岸。需要留意的是，皇崗口岸公共運輸交匯處空間有限，並不設公眾停車場，市民及旅客應使用公共交通工具出行。
新皇崗口岸交通｜專營巴士服務
運輸署安排多條日間及通宵巴士路線，方便旅客往返各區：
九巴 B10：往返葵翠邨公共運輸交匯處（途經大欖隧道轉車站、青衣及葵芳），全程車資 $12.1。
九巴 B11：往返天富巴士總站（途經新田公共運輸交匯處、元朗市中心及天水圍），全程車資 $10.5。
嶼巴 B12：往返烏溪沙站公共運輸交匯處（途經大埔廣福巴士轉車站、科學園及馬鞍山），全程車資 $21。
城巴 B13：往返小西灣（藍灣半島）（途經西區海底隧道轉車站、北角及柴灣等），全程車資 $27.6。
城巴 B14：往返啟德（世運道）（途經啟德體育園，初期於每日繁忙時間提供服務），全程車資 $20.8。
城巴 B15：往返青山灣（途經屯門市中心及屯門南，星期六、日及公眾假期服務），全程車資 $15.5。
九巴 NB73（通宵線）：往返沙田中心（途經上水站及大埔），全程車資 $22.6。
新皇崗口岸交通｜專線小巴服務
44B / 44B1：往返屯門站及屯門碼頭，車資 $15.7。
78：往返八鄉路（近大欖隧道轉車站），車資 $9.7。
通宵路線：包括 79S（天水圍）、N44B（屯門）及 616S（旺角）。
新皇崗口岸交通｜的士及預約服務
交匯處設有市區的士（紅的）及新界的士（綠的）排隊上落客區。此外，現場設有預約的士車隊專屬停車處，乘客可透過八達通「Call車易」或指定車隊應用程式預約服務。注意交匯處不設非的士車隊的預約上客點。
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